Sótthreinsunarreglan natríumhýpóklóríts inniheldur aðallega þrjá þætti:
Ofklórsýra myndast við vatnsrof og undirklórsýra brotnar frekar niður og myndar nýtt vistfræðilegt súrefni. Sterkur oxandi eiginleiki nýs vistfræðilegs súrefnis eykur efni eins og prótein á bakteríur og veirur og drepur þar með sjúkdómsvaldandi örverur.
Blóðklórsýra getur komist inn í bakteríur (veirur) og hvarfast við lífrænar fjölliður eins og bakteríu (veiru) prótein, kjarnsýrur og ensím og drepið þar með sjúkdómsvaldandi örverur.
Klóríðjónirnar sem framleiddar eru af undirklórsýru geta verulega breytt osmósuþrýstingi baktería og veira, sem veldur því að frumur þeirra missa virkni og deyja.